Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZW0

Stk35, Serine/threonine-protein kinase 35, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk35Q80ZW0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Stk35Q80ZW0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Stk35Q80ZW0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stk35Q80ZW0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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