Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cracr2bQ80ZJ8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms