Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms