Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPS0

Rps6ka6, Ribosomal protein S6 kinase alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka6Q7TPS0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps6ka6Q7TPS0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka6Q7TPS0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms