Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms