Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Uhrf2Q7TMI3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Uhrf2Q7TMI3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Uhrf2Q7TMI3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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