Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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