Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ubfd1Q78JW9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ubfd1Q78JW9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ubfd1Q78JW9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubfd1Q78JW9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubfd1Q78JW9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubfd1Q78JW9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ubfd1Q78JW9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ubfd1Q78JW9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms