Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd3eapQ76KJ5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms