Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms