Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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Atp8b3Q6UQ17 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b3Q6UQ17 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
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Atp8b3Q6UQ17 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Atp8b3Q6UQ17 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Atp8b3Q6UQ17 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Atp8b3Q6UQ17 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Atp8b3Q6UQ17 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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Atp8b3Q6UQ17 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b3Q6UQ17 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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