Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms