Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhod1Q6P9Q4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhod1Q6P9Q4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms