Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf6Q6NVF9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms