Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms