Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Papd5Q68ED3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Papd5Q68ED3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Papd5Q68ED3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Papd5Q68ED3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Papd5Q68ED3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Papd5Q68ED3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Papd5Q68ED3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Papd5Q68ED3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Papd5Q68ED3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Papd5Q68ED3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Papd5Q68ED3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Papd5Q68ED3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Papd5Q68ED3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Papd5Q68ED3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Papd5Q68ED3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms