Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms