Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms