Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms