Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Kdm5dQ62240 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
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