Protein–RNA interactions for Protein: Q61382

Traf4, TNF receptor-associated factor 4, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf4Q61382 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf4Q61382 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf4Q61382 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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