Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms