Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms