Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mkrn3Q60764 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms