Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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PtprnQ60673 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PtprnQ60673 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprnQ60673 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PtprnQ60673 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PtprnQ60673 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PtprnQ60673 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprnQ60673 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms