Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zkscan4Q5SZT6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms