Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r195Q5SVD6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r195Q5SVD6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r195Q5SVD6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r195Q5SVD6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vmn1r195Q5SVD6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vmn1r195Q5SVD6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vmn1r195Q5SVD6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vmn1r195Q5SVD6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vmn1r195Q5SVD6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Vmn1r195Q5SVD6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Vmn1r195Q5SVD6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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