Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Sco1Q5SUC9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Sco1Q5SUC9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Sco1Q5SUC9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Sco1Q5SUC9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sco1Q5SUC9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sco1Q5SUC9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms