Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh12Q5RJH3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms