Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8d-2Q5R1B6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms