Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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