Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Fam208bQ5DTT3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam208bQ5DTT3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam208bQ5DTT3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam208bQ5DTT3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam208bQ5DTT3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam208bQ5DTT3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam208bQ5DTT3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam208bQ5DTT3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam208bQ5DTT3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam208bQ5DTT3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam208bQ5DTT3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms