Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2al1nQ497L1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms