Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms