Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms