Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms