Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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