Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp30Q3UN04 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp30Q3UN04 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp30Q3UN04 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp30Q3UN04 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp30Q3UN04 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp30Q3UN04 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp30Q3UN04 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp30Q3UN04 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp30Q3UN04 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp30Q3UN04 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp30Q3UN04 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp30Q3UN04 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp30Q3UN04 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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