Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms