Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms