Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms