Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riiad1Q3KNY5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms