Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms