Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Rpusd3Q14AI6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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