Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms