Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms