Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms