Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms