Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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