Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nucb1Q02819 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nucb1Q02819 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nucb1Q02819 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nucb1Q02819 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nucb1Q02819 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nucb1Q02819 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nucb1Q02819 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nucb1Q02819 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nucb1Q02819 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms